据悉，本标准适用于饮料，不适用于包装饮用水。新标准与被替代的标准相比，对标准名称、理化指标、微生物指标进行了修改。标准名称修改为“食品安全国家标准 饮料”。污染物、真菌毒素、农药残留、食品添加剂、营养强化剂均按照相应的食品安全国家基础标准执行，避免了标准间的矛盾。
污染物限量按照gb2762执行，保留了铅和锡的限量要求，取消了总砷的限量要求；金属罐包装物中的锌、铜、铁容易向果蔬汁饮料中迁移从而影响食品安全，因此新标准保留了原《果、蔬汁饮料卫生标准》对金属罐装果蔬汁饮料中上述三个指标总和的规定；杏仁中含有氢氰酸，对人体有害，大豆中含有天然抗营养因子，主要是蛋白酶抑制剂、皂素、红细胞凝结素等，易引起头晕，恶心、呕吐等胃肠道症状，因此新标准保留了原《植物蛋白饮料卫生标准》中关于氰化物和脲酶实验的要求；此外，新标准还删除了水分、蛋白质、脂肪等品质指标。
微生物方面，菌落总数、大肠菌群以及致病菌全部采用三级采样的方式，并根据产品特点，对菌落总数、大肠菌群、霉菌、酵母区别规定限量，大肠菌群的检测方法由原来的mpn计数法改为平板计数法。
新标准还要求乳酸菌饮料产品标签应标明活菌（未杀菌）型或非活菌（杀菌）型，并要求标示活菌型的产品乳酸菌数应≥106cfu/g（ml）。另外，含有活菌型乳酸菌、需冷藏储存和运输的饮料产品应在标签上标识贮存和运输条件。